整个园区按功能分为5大区:植物专类园区,树木园区、盆景园区、观赏温室科普教育区、花卉交易展示区。

  植物专类园包含植物类型多样,以北方特色的蔷薇科植物为主,以桃、海棠、月季、梅花、樱花、果树划分小区,另外还有木樨园、玉兰园、禾草园、柏类园、彩叶园、竹园、水生禾草园、药用植物园等多个专类小园区。依据植物本身的形态结合周边环境布置,沿分类园边界布置高大乔木密林起屏障作用,沿水岸布置矮灌木丛,疏密有致,温室附近为疏林草地,为游人提供良好的活动及视觉空间。

  树木园以保存徐州乡土树种资源为主,按品种、结合景观营造方式栽植,专门划出暖温带植物南缘树木园区,在园区还设有亲子园。

  盆是专门对盆景艺术进行存放、培育、教学及展示等多种功能为一体的专门性园林景观,占地约750平方米。主要有川派、扬派、苏派、海派、岭南派、徽派6大派系盆景。

  科普教育区主要以展览温室为主,占地约3500平方米,内有800多个品种,以多浆植物,热带花卉与芳香植物、热带蕨类和露兜植物、热带雨林植物、水果能源植物、水生植物,分苏铁和凤梨展览区、珍奇植物展示区、棕榈展示区等,同时设有多媒体展示厅,结合声光电展示植物的生长过程。